如何研究信号传导通路?其实对于一般的信号通路,信号通路图在哪里找信号转导图在NCBI（）。如何查找两个基因是否在信号通路间存在联系代谢通路：目前在通路数据库(PATHWAYdatabase)中代谢通路是建立得最好的，有大约90个参考代谢途径的图形，信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路。

你认为你的细胞只是简单的积木，无意识的和静态的，就像墙上的砖块?如果是的话，再想想!细胞能够探测到周围发生的事情，并且能够对来自邻居和环境的提示做出实时反应。此时此刻，你的细胞正在以化学信号分子的形式发送和接收数以百万计的信息!在本文中，我们将研究细胞之间如何通信的基本原理。我们将首先了解细胞细胞信号是如何工作的，然后考虑在我们体内发生的不同种类的短距离和长程信号。

这些化学信号是由发送细胞产生的蛋白质或其他分子，通常由细胞分泌并释放到细胞外空间。在那里，它们可以像漂流瓶一样漂浮到邻近的细胞。并不是所有的细胞都能“听到”特定的化学信息。为了检测到一个信号(也就是说，成为一个目标细胞，targetcell)，相邻的细胞必须有合适的受体（receptor）来接收这个信号。当信号分子与受体结合时，它改变了受体的形状或活动，触发了细胞内部的变化。

确定某种因子在信号传导通路的上游或下游方法：将两种因子A和B分别做基因沉默，沉默Agene看看A和B表达的情况，然后沉默Bgene再看看A和B表达的情况。上游的因子被沉默表达后，下游的因子肯定表达下调或不表达。而下游因子被沉默表达后，上游因子的表达不会受影响。还可以做个免疫共沉淀，看看上游因子是不是直接结合（作用）于下游因子的基因启动子区，开启下游表达。

代谢通路：目前在通路数据库(PATHWAYdatabase)中代谢通路是建立得最好的，有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有的代谢通路：先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。然后合理地安排EC号。最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物结合起来。

查外文文献啦。一堆一堆的。在KEGG或BioCarta这些pathway数据库里找到你感兴趣的通路，在pathway图上找到你感兴趣的蛋白后就能确认它的下游。实验方法大体上就是上调（瞬时表达、mimics）或下调（Knockout、RNAi）你的GeneofInterest，再检测下游的蛋白发生了上调还是下调，看看你的GOI和它们什么联系。

信号转导图在NCBI（）。其实对于一般的信号通路,我们基本可以通过以下途径中获得的,一个就是很ncbi中获得,另外一个就是从大的试剂公司中获得的,基本上可以满足我们常见的信号通路,而且制作都非常精美。http:/cgap.nci.nih.gov/Pathways/BioCarta_Pathways,在页面的旁边有pathwaysearcher,

信号通路（signalpathway）的提出最早可以追溯到1972年，不过那时被称为信号转换（signaltransmission）。1980年，M.Rodbell在一篇综述中提到信号转导（signaltransduction），此后这个概念就被广泛使用了[4]。信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路。

当配体特异性地结合到细胞膜或细胞内的受体（receptor）后，在细胞内的信号又是如何传递的呢？细胞内各种不同的生化反应途径都是由一系列不同的蛋白组成的，执行着不同的生理生化功能。各个信号通路中上游蛋白对下游蛋白活性的调节（包括激活或抑制作用）主要是通过添加或去除磷酸基团，从而改变下游蛋白的立体构象完成的。所以，构成信号通路的主要成员是蛋白激酶和磷酸酶，它们能够快速改变和恢复下游蛋白的构象。

原文：信号通路研究思路_百度文库证明一个药物能通过抑制P38表达而发挥保护细胞的作用，需要做的是：要证明你的药物是通过抑制P38表达而发挥保护作用，首先，要证明P38表达增加会导致损伤。其次，要证明你的药物存在保护作用。再次，证明你的药物可以抑制P38表达。最后，证明你的药物是由于抑制了P38表达而发挥保护作用。这里需要建立一个损伤模型。

这时，对P38做个RNA干扰，使其表达下降，再来损伤刺激，如果这时损伤刺激不会导致损伤，那么可以说P38mapk的增高会导致损伤。这里最好不要用P38的抑制剂SB来处理，因为这个抑制剂是针对P38活性的抑制剂，抑制的是P38的磷酸化，而不是表达量，如果说明的问题是p38磷酸化水平增加而导致损伤，那么我建议用抑制剂。这时还可以用Dominantnegative。